Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATRIPQ8WXE1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATRIPQ8WXE1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms