Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RUFY2Q8WXA3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms