Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMO7Q8WWI1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms