Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HJURPQ8NCD3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms