Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY92

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, humanhuman

Predictions only

Length 1,834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4Q8IY92 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLX4Q8IY92 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLX4Q8IY92 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms