Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXP5

C11orf53, Uncharacterized protein C11orf53, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf53Q8IXP5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C11orf53Q8IXP5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C11orf53Q8IXP5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C11orf53Q8IXP5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C11orf53Q8IXP5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C11orf53Q8IXP5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C11orf53Q8IXP5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C11orf53Q8IXP5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C11orf53Q8IXP5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C11orf53Q8IXP5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C11orf53Q8IXP5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C11orf53Q8IXP5 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C11orf53Q8IXP5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C11orf53Q8IXP5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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