Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC84Q86UT8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms