Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
WDR53Q7Z5U6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms