Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NUP54Q7Z3B4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms