Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAD11Q709F0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms