Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN30

BNC2, Zinc finger protein basonuclin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC2Q6ZN30 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BNC2Q6ZN30 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BNC2Q6ZN30 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms