Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TTC41PQ6P2S7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms