Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CREB3L3Q68CJ9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CREB3L3Q68CJ9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms