Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLX4IPQ5VYV7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms