Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PRAMEF6Q5VXH4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms