Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BROXQ5VW32 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms