Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PXDC1Q5TGL8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms