Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM74A1Q5RGS3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms