Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
WDR44Q5JSH3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms