Protein–RNA interactions for Protein: Q5JPI3

C3orf38, Uncharacterized protein C3orf38, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf38Q5JPI3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C3orf38Q5JPI3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C3orf38Q5JPI3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms