Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HSP90AB4PQ58FF6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms