Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC153Q494R4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms