Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
KRTAP21-1Q3LI58 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms