Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPA4

CR1L, Complement component receptor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CR1LQ2VPA4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CR1LQ2VPA4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CR1LQ2VPA4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CR1LQ2VPA4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CR1LQ2VPA4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CR1LQ2VPA4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CR1LQ2VPA4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CR1LQ2VPA4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CR1LQ2VPA4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CR1LQ2VPA4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CR1LQ2VPA4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CR1LQ2VPA4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CR1LQ2VPA4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms