Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYSND1Q2T9J0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYSND1Q2T9J0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms