Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Q1T7F1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Q1T7F1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
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