Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC5A12Q1EHB4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC5A12Q1EHB4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms