Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTF1Q16619 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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