Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SGCBQ16585 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SGCBQ16585 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
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