Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SLC18A3Q16572 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC18A3Q16572 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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