Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS72Q15906 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS72Q15906 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
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