Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USF2Q15853 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USF2Q15853 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USF2Q15853 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USF2Q15853 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USF2Q15853 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USF2Q15853 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USF2Q15853 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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