Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
VAMP3Q15836 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
VAMP3Q15836 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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