Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHRNA6Q15825 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.5 ms