Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NCOA1Q15788 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
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NCOA1Q15788 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
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NCOA1Q15788 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
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NCOA1Q15788 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NCOA1Q15788 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
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