Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EFNB3Q15768 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms