Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYCP1Q15431 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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