Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE3CQ15386 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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UBE3CQ15386 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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UBE3CQ15386 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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UBE3CQ15386 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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UBE3CQ15386 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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UBE3CQ15386 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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UBE3CQ15386 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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UBE3CQ15386 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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UBE3CQ15386 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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UBE3CQ15386 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3CQ15386 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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