Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IRF4Q15306 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms