Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
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BRD3Q15059 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRD3Q15059 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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