Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB3GAP1Q15042 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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