Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RAB39AQ14964 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RAB39AQ14964 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms