Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GRIN2CQ14957 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GRIN2CQ14957 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms