Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
COL9A3Q14050 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COL9A3Q14050 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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