Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPSQ13938 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CAPSQ13938 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms