Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EXOSC2Q13868 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms