Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDAC1Q13547 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HDAC1Q13547 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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