Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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PAPPAQ13219 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPPAQ13219 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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