Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SEMA3BQ13214 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms