Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPS1Q13098 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GPS1Q13098 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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